Dominik Niopek (* 1. Mai 1987 in Speyer) ist ein deutscher Biowissenschaftler und Hochschullehrer. Er ist Professor für Pharmazeutische Biologie an der Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg und Leiter der Forschungsgruppe „Synthetische Biologie“ am Institut für Pharmazie und Molekulare Biotechnologie (IPMB). Seine Forschungsschwerpunkte liegen in den Bereichen synthetische Biologie, Protein-Engineering, Optogenetik und der kontrollierten Anwendung von CRISPR-Technologien.
Leben und Ausbildung Niopek studierte Molekulare Biotechnologie an der Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg. Dort wurde er mit einer Dissertation zur optogenetischen Kontrolle nukleozytoplasmatischer Proteintransporte promoviert.
Für seine Arbeiten und sein Engagement in der Wissenschaftskommunikation wurde er unter anderem mit dem KlarText-Preis für Wissenschaftskommunikation ausgezeichnet.
Wissenschaftliche Laufbahn Nach seiner Promotion forschte Niopek unter anderem am Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ). Er baute seine wissenschaftliche Expertise insbesondere in den Bereichen Optogenetik, Protein-Design und der gezielten Steuerung zellulärer Prozesse aus.
Niopek ist Professor am Institut für Pharmazie und Molekulare Biotechnologie (IPMB) der Universität Heidelberg, wo er die Abteilung Pharmazeutische Biologie mit dem Schwerpunkt synthetische Biologie leitet. Seine Forschungsgruppe entwickelt molekulare Werkzeuge zur präzisen räumlichen und zeitlichen Kontrolle biologischer Prozesse in lebenden Zellen.
Ein Schwerpunkt seiner Arbeit liegt auf der Entwicklung künstlicher Proteine und allosterischer Proteinschalter. Hierbei kombiniert er experimentelle Methoden mit rechnergestützten Ansätzen und maschinellem Lernen, etwa im Rahmen des Projekts „ProDomino“ zur KI-gestützten Konstruktion neuer Proteine.
Forschungsschwerpunkte Synthetische Biologie Protein-Engineering und künstliche Proteine Optogenetik Steuerbare CRISPR- und Anti-CRISPR-Systeme Einsatz von maschinellem Lernen in der molekularen Biologie
Ausgewählte Publikationen F. Bubeck, M. Hoffmann, Z. Harteveld u. a.; D. Niopek: Engineered anti-CRISPR proteins for optogenetic control of CRISPR-Cas9. In: Nature Methods. 15, 2018, S. 924–927. DOI:10.1038/s41592-018-0178-9. J. Mathony, Z. Harteveld, C. Schmelas u. a.; D. Niopek: Computational design of anti-CRISPR proteins with improved inhibition potency. In: Nature Chemical Biology. 16, 2020, S. 725–733. DOI:10.1038/s41589-020-0518-9. L. Adam, M. Stanifer, F. Springer u. a.; D. Niopek: Transcriptomics-inferred dynamics of SARS-CoV-2 interactions with host epithelial cells. In: Science Advances. 6, 2020. DOI:10.1126/sciadv.aay0187. T. Stadelmann, D. Heid, M. Jendrusch u. a.; D. Niopek: A deep mutational scanning platform to characterize the fitness landscape of anti-CRISPR proteins. In: Nucleic Acids Research. 52, 2024. DOI:10.1093/nar/gkae1052. B. Wolf, P. Shehu u. a.; D. Niopek: Rational engineering of allosteric protein switches by in silico prediction of domain insertion sites. In: Nature Methods. 2025. DOI:10.1038/s41592-025-02741-z.
Herausgeberschaft D. Niopek (Hrsg.): Photoswitching Proteins: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology, Springer, 2020.
Weblinks Niopek Lab – Forschungsgruppe Synthetische Biologie Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
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