Dit is een lijst van afleveringen van seizoen 3 van SpongeBob SquarePants. Dit seizoen telt 20 afleveringen. De eerste aflevering van dit seizoen werd op 5 oktober 2001 in de Verenigde Staten uitgezonden. Het programma werd tijdelijk stopgezet tot 24 januari 2003. De afleveringen werden iedere paar maanden uitgezonden na die datum tot 11 oktober 2004, toen de laatste aflevering "SpongeBob Meets the Strangler/Pranks a Lot" verscheen. Daarna werd de serie stopgezet en seizoen 4 werd pas op 6 mei 2005 vervolgd.
Aflevering (seizoen) Aflevering (serie) Eerst uitgezonden in VS Titel Beschrijving14122 maart 2002The Algae's Always Greener(Hoe het is om meneer Krabs te zijn)Plankton wil weten hoe het is om zo succesvol te zijn als meneer Krabs en hij wil ook het geheime recept stelen van de Krabburger. Het blijkt echter dat meneer Krabs aan ontzettend veel dingen moet denken, zoals het belang van de klanten (Die Plankton nooit heeft), zijn dochter Parel en de werknemers. Plankton wordt er helemaal gek van en gaat terug naar zijn oude vertrouwde, lege Maatemmer.SpongeGuard on Duty(De strandwacht)SpongeBob kijkt op tegen Leendert, de strandwacht. Hij hoopt dat hij net zo cool is als Leendert en hij zegt dat als het niet zo is, dat er dan een ijscowagen op hem mag landen. Dat gebeurt dus en zijn neus komt in een ijsje terecht, waardoor het lijkt alsof SpongeBob ook strandwacht is. Leendert en SpongeBob zijn een tijdje samen strandwacht, maar dan gaat Leendert uit. SpongeBob kan niet zwemmen en hij sluit de zee, tot ergernis van de strandgasten.24212 juli 2002Club SpongeBob(De magische schelp)SpongeBob en Patrick vormen hun eigen club, met een clubhuis waar bijna geen ruimte is. Octo wil bij de club komen, omdat SpongeBob zegt dat Octo er niet bij zou passen. SpongeBob bedoelt het letterlijk, maar Octo denkt dat SpongeBob bedoelt dat Octo niet goed genoeg is. Hij komt erbij en heeft er al snel genoeg van. Hij wil naar buiten gaan, maar dan schiet het clubhuis naar een algenbos, ver weg van de bewoonde wereld. Octo zoekt een weg naar buiten, maar zonder succes. SpongeBob en Patrick luisteren ondertussen naar de Magische Schelp, die zegt dat ze niets moeten doen. Dat werkt verrassend genoeg in hun voordeel.My Pretty Seahorse(Mysterie)SpongeBob vindt een zeepaard in de buurt van zijn huis en besluit om het zeepaard in huis te nemen. Hij noemt haar Mysterie. Als SpongeBob haar op een dag mee naar werk neemt, probeert meneer Krabs van Mysterie af te komen. SpongeBob besluit om Mysterie in het restaurant te verbergen. Hij komt er dan achter dat het moeilijk is om zowel te koken als tegelijkertijd een wild dier te moeten verstoppen, want Mysterie eet alles wat ze maar kan zien, waaronder een van de klanten.3435 oktober 2001Just One Bite(Octo is om)SpongeBob komt erachter dat Octo nog nooit een Krabburger heeft gehad. SpongeBob doet er alles aan om ervoor te zorgen dat Octo er een zal eten, maar Octo wil dat helemaal niet. Maar als hij eenmaal één hapje heeft gehad, is hij er helemaal verslaafd aan. Hij wil het niet laten merken aan SpongeBob, dus gaat hij 's nachts naar de Krokante Krab om in de kluis in te breken waar alle Krabburgers in zitten. SpongeBob is er toevallig ook en hij merkt dat Octo de Krabburgers wel lekker vindt. SpongeBob wil Octo vertellen dat Octo veel te veel Krabburgers eet. Maar het is te laat, het vet zakt naar Octo's dijen en hij explodeert.