Basse-Kotto (Sango: Do-Kötö) is een van de twintig prefecturen van de Centraal-Afrikaanse Republiek. Het heeft een oppervlakte van 17.604 km² en heeft 393.296 inwoners (2004). De hoofdstad is Mobaye.
De prefectuur Basse-Kotto is onderverdeeld in de subprefecturen Alindao, Kendé, Mingala, Mobaye, Satéma en Zangba.
Categorie:Prefectuur van de Centraal-Afrikaanse Republiek