De Pauselijke Commissie Ecclesia Dei was een commissie van de Rooms-Katholieke Kerk die trachtte bepaalde traditionalistische katholieken, voornamelijk de priesterbroederschap Sint Pius X, terug in volle communio met Rome te brengen. De commissie werd op 2 juli 1988 opgericht door het motu proprio Ecclesia Dei van paus Johannes Paulus II.
Op 12 maart 2009 kondigde paus Benedictus XVI aan dat de Commissie Ecclesia Dei zou gaan vallen onder het gezag van de Congregatie voor de Geloofsleer. De paus wilde daarmee benadrukken dat de geschillen tussen het Vaticaan en de Priesterbroederschap St. Pius X vooral theologisch en leerstellig van aard zijn.Letter concerning the remission of the excommunication of the four Bishops consecrated by Archbishop Lefebvre Op 2 juli 2009 werd aan dit voornemen verder uitvoering gegeven met het motu proprio Ecclesiae Unitatem.
Op 17 januari 2019 werd de commissie opgeheven als zelfstandig orgaan. Het beleidsterrein werd daarna verzorgd door de Congregatie voor de Geloofsleer.
Voorzitter van de commissie1988 - 1991Paul Mayer 1991 - 1995Antonio Innocenti1995 - 2000Angelo Felici2000 - 2009Darío Castrillón Hoyos2009 - 2012William Levada2012 - 2017Gerhard Ludwig Müller2017 - 2019Luis Ladaria Ferrer
Externe links Commissie Ecclesia Dei op www.vatican.va Website van de Commissie
†Ecclesia Dei †