Koundara is een prefectuur in de regio Boké van Guinee. De hoofdstad is Koundara. De prefectuur heeft een oppervlakte van 5.300 km² en heeft 129.974 inwoners.
De prefectuur ligt in het noordwesten van het land in het hoogland van Fouta Djalon, grenzend aan Guinee-Bissau en Senegal.
Subprefecturen De prefectuur is administratief verdeeld in 7 sub-prefecturen: Koundara-Centre Guingan Kamaby Sambailo Saréboido Termesse Youkounkoun
thumb|left|Landschap in Koundara
Categorie:Prefectuur van Guinee