In deze (incomplete) lijst staan de kerkgebouwen die te boek staan als Waterstaatskerk. Hiervan is de bouw, of restauratie, gefinancierd door Rijkswaterstaat.
Kerk Jaar Architect Adres Plaats Huidige functie Bijzonderheden Foto Onze-Lieve-Vrouw-Presentatiekerk 1846 Aarle-Rixtel 150px|center Sint-Laurentiuskerk 1861 Pierre Cuypers Alkmaar 150px|center Mozes en Aäronkerk 1841 Tieleman Franciscus Suys Waterlooplein 207 Amsterdam 150px|center Kerk van de Heilige Maagd Maria-Tenhemelopneming 1829 Grote Markt 32 Bergen op Zoom Sinds 1990 Theater De Maagd 150px|center Sint-Antoniuskathedraal 1837 Pieter Huijsers Breda 150px|center St. Nicolaas Pieck en Gezellenkerk 1838 J. van Nune Haarstraat 23 Gorinchem 150px|center Heilige Nicolaaskerk 1827 Voorhaven 124 Edam 150px|center Sint-Martinuskerk 1837 Oliestraat 28 Zaltbommel Alleen het middenschip is overgebleven na een grote verbouwing 150px|center Vermaning 1867 Dorpsstraat K149 Twisk 150px|center Teresia van Avilakerk 1841 Tieleman Franciscus Suys Westeinde 12A Den Haag Op zondagen worden de diensten in het Pools gehouden, er worden geen Nederlandstalige diensten meer gehouden. 150px|center Nieuwe Kerk 1839 H.H. Dansdorp Nieuwe Kerkplein 2 Den Helder Oudste kerk in Den Helder 150px|center Hervormde Kerk 1829 Doornspijk 150px|center Heilige Lucaskerk 1836 G. Holland Huissensedijk 4 Elden Woon- en bedrijfspand Gebouw is buiten gebruik gesteld na bouw van nieuwe kerk, in het gebouw bevinden zich sindsdien woonhuizen 150px|center Stephanuskerk 1848 Voorstraat 36 Hardenberg 150px|center Hartebrugkerk 1836 Th. Molkenboer Haarlemmerstraat 110 Leiden 150px|center Sint Petrus' Banden 1830 P. Adams Rotterdam-Overschie 150px|center Sint-Augustinuskerk 1840 Karel George Zocher Oude Gracht Utrecht 150px|center Koningskerkje 1843 Vierlingsbeek 150px|center Sint-Janskerk 1829 Waalwijk gesloopt in 1922 gecentreerd|kaderloos|150x150px Sint-Bartholomeus- en Barbarakerk 1841 E. de Kruyff Waspik 150px|center Kerk van Nieuw-Beerta 1856 Willem Hardhoff Hoofdweg 18 Nieuw-Beerta 150px|center Kluizenarij Onze-Lieve-Vrouwe van de Besloten Tuin 1858 Warfhuizen 150px|center Sint-Bonifatiuskerk 1826 P. Plukhooy Wijnstraat 117 Dordrecht Jongerencentrum 150px|center Koepelkerk 1826 H. Wind Hoofdweg 112 Veenhuizen Naar voorbeeld van de Koepelkerk in Smilde gebouwd. De kerk is eigendom van het Rijksvastgoedbedrijf. 150px|center Kerk van Laren 1835 Bernardus van Zalingen Dorpsstraat 2 Laren 150px|center St Josephkerk 1841 P.J. Adema Jansstraat 43 Haarlem 150px|center Kerk van Uitwierde 1839 Uitwierde 150px|center Sint-Martinuskerk 1851 Theo Molkenboer Dr. Nuyenstraat 80 Westwoud 150px|center Onze-Lieve-Vrouw Visitatiekerk 1846 Theo Molkenboer Oosterblokker 68 Oosterblokker 150px|center Michaëlskerk 1853 Theo Molkenboer Westerblokker 44 Blokker 150px|center Sint-Barnabaskerk 1854 Haastrecht 150px|center Dorpskerk 1863 Melissant 150px|center Hervormde kerk 1840 Gieterveen 150px|center Ned. Hervormde kerk 1858 Gasselternijveen 150px|center Goirkese kerk 1838 Goirkesestraat 68-70 Tilburg Eerste neogotische waterstaatskerk (ook wel 'Willem II-gotiek') 150px|center Groenmarktkerk 1844 Nieuwe Groenmarkt 16 Haarlem 150px|center Hervormde kerk 1853 Hoofdstraat 19 Grolloo 150px|center Hervormde kerk 1871 J. de Haan en H.G. Gallay Middenweg 168 Heerhugowaard Multifunctioneel centrum De kerk is beschermd als gemeentelijk monument. 150px|center Hoflaankerk 1842 A. Roodenburg Hoflaan 1 Rotterdam In gebruik bij de Hervormde Gemeente Kralingen In de voortuin staat een replica van het eerste verkeersbord van Nederland. 150px|center Sint-Jacobus de Meerderekerk 1837 H.H. Dansdorp Liedeweg 52 Haarlemmerliede 150px|center Sint-Jacobus de Meerderekerk 1858 Theo Molkenboer Wilhelminastraat Vlissingen Gesloopt in 1938 150px|center Sint-Janskerk 1839 Markt 2 Roosendaal 150px|center Sint-Johannes de Doperkerk 1873 Theo Asseler Heereweg 171 Catrijp Gesloopt Op dezelfde plek staat sinds 1971 een modernistische opvolger 150px|center Johannes Nepomukkerk 1838 Jan Baptist van der Hulst Vissersdijk 15 Woudrichem 150px|center Jozefkerk 1848 C.J. Spaan Kerkplein 1 Assen Het jaartal in het fronton is in 2002 aangebracht. 150px|center Kerk van Farmsum 1869 C. Wind Farmsum 150px|center Kerk van Wilhelminaoord 1851 Koningin Wilhelminalaan 55 Wilhelminaoord 150px|center Kouwenbergs kerkje 1847 Kouwenberg 29 Aarle-Rixtel Gesloopt Huidige kerk stamt uit 1873 150px|center Sint-Lambertuskerk 1861 Theo Molkenboer Kerkstraat 54 Helmond De kern van de toren stamt uit de middeleeuwen en heeft ten tijde van de bouw van de kerk een neogotische buitenlaag gekregen. De achtzijdige torenspits is eveneens nieuw. 150px|center Sint-Lambertuskerk 1841 J.H. Laffertée Slimstraat 9 Udenhout Neoclassicistische hallenkerk 150px|center Sint-Ursula en Gezellinnenkerk 1873 Theo Asseler Dorpsstraat 177 Warmenhuizen Neoromaanse basilicale kerk 150px|center Petrus en Pauluskerk 1852 Soest 150px|center Sint-Sebastianuskerk 1870 Theo Asseler Dorpsstraat 58 Ilpendam 150px|center Op Hodenpijl 1840 Arend Roodenburg Hodenpijl De kerk werd in 1963 aan de eredienst onttrokken. 150px|center Onze-Lieve-Vrouw Hemelvaartkerk 1839 Theo Molkenboer Haarlemmerstraat 262 Leiden Gesloopt in 1979 Na sluiting werd het gebouw verbouwd tot overdekt zwembad. Het bad opende in 1937 de deuren en in 1974 werd het gesloten. Op de plek staan nu woningen. 150px|center Petrus en Pauluskerk 1840 H.H. Dansdorp Kerkgracht 54 Den Helder 150px|center Sint-Machutuskerk 1831 Choorstraat 103 Monster 150px|center Maria Geboortekerk 1839 Dronrijp 150px|center Onze-Lieve-Vrouw Visitatiekerk 1853 W. Thijssen Hoefweg 57 Bleiswijk 150px|center Maria ten Hemelopneming 1845 Hasselbach Boven Oosterdiep 79 Veendam In jaren 1920 is de kerk uitgebreid met een koor in neogotische stijl. 150px|center Sint-Martinuskerk 1854 Theo Molkenboer Rijdersstraat 107 't Veld 150px|center Onze-Lieve-Vrouwekerk 1854 Theo Molkenboer Keizersgracht 220 Amsterdam In gebruik bij de Syrisch-Orthodoxe Kerk van Antiochië en een aantal andere kerkgenootschappen 150px|center Sint-Petruskerk 1836 Leiden 150px|center Sloterkerk 1860 Pieter Johannes Hamer Osdorperweg 28 Sloten In 2011 is er vanwege het 150-jarig jubileum een nieuw muuranker geplaatst. 150px|center Willibrordkerk 1826 Hoofdstraat 34 Borger De kerk is een Waterstaatskerk en staat tegen een 14e-eeuwse toren. 150px|center Sint-Willibrordkerk 1841 Kerkstraat Casteren Gesloopt Huidige kerk is in 1907 gebouwd op de plek van de oude kerk. Sint-Willibrorduskerk 1843 H. Bauer Spalstraat 36 Hengelo Van de toren is het gedeelte tot en met de eerste geleding de originele toren. Tijdens een storm in 1883 raakte de bekroning met lantaarn beschadigd en stortte in. Met een tweede geleding werd de toren verhoogd en daar bovenop werd een ingesnoerde achtkantige torenspits gebouwd. 150px|center Sint-Willibrorduskerk 1845 Kerkeind 37 Milheeze De basis van de toren zou mogelijk nog van de voorgaande kapel kunnen zijn. 150px|center Witte Kerk 1832 Kerkplein 7 Steenbergen De kerk werd samen met de voorganger van de Sint-Gummaruskerk gebouwd, opdat beide geloofsgemeenschappen een nieuwe kerk kregen. 150px|center Ned. Hervormde kerk -- Evert Jenni Kerkstraat 32 Velp 150px|center Onze-Lieve-Vrouw Hemelvaartkerk 1846 Achthuizen 150px|center Sint Martinuskerk 1843 Kerkstraat 98 Luyksgestel Gesloopt Vervangen in 1958 door de huidige Sint Martinuskerk, welke beschermd is als rijksmonument Kerk van Durgerdam 1840 Durgerdammerdijk 76 Durgerdam 150px|center Waterstaatskerk 1848 Deldenerstraat 18 Hengelo Sinds 2017 weer in gebruik als kerk 150px|center Sint-Catharinakerk 1842 Jos de Kroon ’s-Hertogenbosch Gesloopt De kerk is wegens bouwvalligheid vervangen door de huidige Sint-Catharinakerk. Sint-Pieterskerk 1842 J.H. Laffertée Achter de Tolbrug ’s-Hertogenbosch Gesloopt in 1982 Op de plek van de kerk ligt nu een binnenhof 150px|center Sint-Jacobskerk 1844 Arnoldus van Veggel Hinthamerstraat 's-Hertogenbosch Gesloopt in 1902 De Nieuwe Sint-Jacobskerk staat op de plek van diens voorganger. H.H. Simon en Judaskerk -- Lattrop Gesloopt Delen van het interieur zijn over gegaan naar de huidige kerk, waaronder de banken (zie foto) 150px|center Hervormde kerk 1873 H. C. Winters Vaart ZZ 86 Nieuw-Amsterdam 150px|center Sint-Pieterskerk 1846 J. Bourdrez Lange Noordstraat Middelburg Verwoest in 1940 Vervangen door de Petrus en Pauluskerk op een andere locatie. Sint Johannes Onthoofdingkerk 1838 J. van der Reydt Dorpsstraat 25 Soerendonk 150px Van Goghkerkje 1824 Papenvoort 2a Nuenen Trouwlocatie 150px Onze-Lieve-Vrouw Onbevlekt Ontvangen 1856 Theo Molkenboer Korte Zijlweg 5 Overveen Kerk is nog in gebruik Kerk is grotendeels van hout, alleen de buitenmuren zijn gemetseld. 150px Nederlandse Hervormde Dorpskerk 1828 Arnhemseweg 75A Leusden Kerk is nog in gebruik Gemaakt in classicistische stijl, vermengd met traditionele elementen 150px Sint-Michaëlkerk 1841 Theo Molkenboer Nieuwstraat 41 Zwolle Appartementen Parochie verhuisde in 1892 naar een nieuw kerkgebouw aan de Roggenstraat.150px