De CECAFA Cup 1999 was de 23e editie van de CECAFA Cup georganiseerd door de CECAFA (Confederation of East and Central Africa Football Association). Het toernooi duurde van 24 juli tot en met 7 augustus 1999 en werd gehouden in Rwanda. Er deden 12 landen mee, maar het thuisland stuurde 2 teams naar het toernooi. Rwanda deed mee met een A-team en een B-team. Het B-team won het toernooi door in de finale Kenia met 3–1 te verslaan. Het A-team van Rwanda werd derde.
Deelnemers
(A-team) (thuisland) (B-team) (thuisland)
(titelverdediger)
Groepsfase Groep A TeamPtn.GSWGVDTDVDS (A-team)4211041+34211021+10200226–4
Groep B TeamPtn.GSWGVDTDVDS4211030+34211020+20200205–5
Groep C TeamPtn.GSWGVDTDVDS4211020+2220201101201113–2
Groep D TeamPtn.GSWGVDTDVDS6220020+2 (B-team)1201112–11201112–1 Rwanda won de loting.
Knock-outfase
Kwartfinale
Halve finale
Troostfinale
Finale
Winnaar CECAFA Cup 199920px50px|RwandaRwanda1e titel
Externe links Officiële website van de CECAFA CECAFA Cup 1999 op rsssf
Categorie:Voetbal in 1999 Categorie:Voetbal in Rwanda Categorie:CECAFA Cup Categorie:Sportevenement in Rwanda